达尔文进化论被推翻的证据是达尔文进化论被生物分子科学推翻。进化无法在分子水平上解释生物现象，比如动物的眼睛。眼睛等复杂的器官，不是慢慢进化就能完成的。他们必须同时合作。任何一个小因素都是不可或缺的。进化论无法解释的另一件事是寒武纪的生命大爆发。
根据进化论，从原始生物到后来的生物都应该有化石来证明生命，但是寒武纪之前没有化石，寒武纪早期突然出现大量化石，这是进化论无法解释的。
补充内容：物竞天择，适者生存是达尔文《进化论》的核心。自从他的理论提出的那一天起，就再也没有发现进化物体的化石证据，所以达尔文的《进化论》一直受到质疑。其中最激进的是宗教，达尔文自己在晚年也做过忏悔。但是《进化论》至今没有被推翻，各国的《生物学》教科书仍然以达尔文的《进化论》为理论基础。众所周知，化石是证明物种存在的唯一物证。没有一个物种的化石是在变化的。不能说是《进化论》的先天缺陷。就连他自己也承认，——是一个不完善的地质记录。最近去世的霍金也对达尔文的《进化论》提出了质疑。他对人类的起源提出了完全不同的看法。当然，这些还有待证明。但是，霍金的结论很有意思。他认为最终坚持下来的不是人类——生物，而是人工智能。根据达尔文的“物竞天择，适者生存”的理论，非生物人工智能确实更聪明、更强大，可以抵御外界的一切恶劣条件。如果最终存在的真的是非生物，达尔文将如何解释？长期以来，达尔文老师提出的进化论一直被认为是人类起源的基本理论。然而，正是在这个世纪，随着科学的飞速发展，科学家、考古学家、地质学家和古生物学家在世界各地发现了各种远超现代文明史的文物古迹。比如5万年前的人造心脏，10万年前的螺丝钉，20万年前的核反应堆，25万年前的壁画，沉没在海底最深处的史前文明遗址等等。这些发现让人们重新探索一个问题。人真的是被猿改变的吗？因此，科学家们不得不对人类起源的定义有新的认识。他们认为人类文明并没有进化，也不像之前科学认为的只有一万年。而且过去的科学并不发达和完善，所以最早的科学认识一定是错误的。由于教育的内容有限，大部分人往往会陷入一种思维误区，会让他们认为课本上的理论都是正确的，不可更改的。但是，在科学发达的今天，还保留这种旧观念，有点滑稽。在科学家眼里，科学的进步和更新在于敢于突破前人的定义，重新认识一些东西。因此，科学家提出了“史前文明”的新理论。那么什么是史前文明呢？也就是在这个人类文明之前出现的人类文明。而且这个文明不是一次出现，而是多次出现。在阎罗王人的记载中，他们认为在此之前地球上已经出现了四个超人文明，也就是所谓的四个太阳时。但科学家对这种说法保持客观态度，科学界认为在此之前人类文明应该还有更多次，而不仅仅是四次。但是到底出现了多少文明，还在研究探索中。科学家还给出一个更令人惊讶的答案：一些史前文明甚至超过了现代地球上的文明，当时的科技发展水平也超出了我们今天的水平。但人类总有一天会超越那些文明，但随时到来的可能是整个地球的湮灭，然后重生。很多很多年后，新的文明会再次出现，到了一定的时候，可能会再次面临湮灭。这意味着真正的人类文明史是一个持续的循环，就像人体内的新陈代谢一样。随着旧细胞的解体，新细胞就会诞生，很快这个新细胞就会分裂——解体，新细胞又会出现，周而复始。换句话说，我们普遍认为“上下五千年”并不是人类唯一存在的文明，而只是人类文明的很短一部分。在此之前，还有非常遥远的史前文明。
然而所有这些文明最终都消失了。是什么原因导致了这些古文明的消失？其实不难找到答案。科学家给出了两个答案。原因之一是因为大陆板块的变化，原来的陆地变成了海洋。比如亚特兰蒂斯和中国这两个高级文明，一夜之间消失在陆地上，却在无数年后从海底被发现。少数人在史前就有过文明，所以根本不会有人类。这样看来，进化论显然是站不住脚的。大量的研究和发现证明，猿进化成人类显然是无稽之谈。《物种起源》出现在19世纪，当时人类科学还很模糊。达尔文只是一个生物学家，不是科学家。如今，他的理论漏洞百出。当然，达尔文老师最终推翻了自己的进化论。到了晚年，他告诉家人和学生，他的理论是错误的，以后会有很多人批评他。所以，如果盲目相信进化论，无疑是最愚蠢的表现。科技的发展，文明的重生，人类的知识必须跟上，否则就会脱离现实，脱离这个时代。十几年前，人们还在敬畏手机的神奇，但短短十年，你的手机基本上可以用来做你想做的一切。如果你还停留在宁愿相信怪力有五仙、王座老君、猪八戒、玉帝等等，而不相信宇宙、科技、外星文明的观念，你注定是个失败者。
