“一体两翼”党建新理念坚持辩证唯物主义方法论，开创了全面从严治党系统思维的新境界。其系统思维集中体现在整体性系统思维、思想建党的系统思维和制度治党的系统思维。
整体系统思维。“一体两翼”党建思想新模式表明，全面从严治党既有赖于思想教育的自律，也有赖于制度规范的辩证思考。作为中国共产党人的政治实践，全面从严治党需要强大的思想自觉，这种思想自觉不仅来源于思想教育，从长远看也离不开制度规范。就内因和外因而言，党建包括两个层面：一是自律，二是他律。自律层面的建设主要体现在思想建党上，他律层面的建设主要体现在制度治党上。两者协调发展，才能真正推动全面从严治党向纵深发展。全面从严治党需要内化于心，外化于行。“内化于心”主要是思想问题，体现在思想建党上；“实践外化”主要是制度问题，体现在党的制度治理方面。所以，思想建党和制度建党统一在从严治党上。2014年，习近平总书记在党的群众路线教育实践活动总结大会上明确指出，“新形势下，必须坚持思想建党和制度建党紧密结合，使加强制度建党的过程成为加强思想建党的过程，加强思想建党的过程也成为加强制度建党的过程。”党的十九大明确指出“思想建党和制度治党同向推进”“全面推进党的政治建设、思想建设、组织建设、作风建设、纪律建设，使制度建设贯穿始终”，这些都是党的建设制度的明确体现。总的来说，自律和他律就像飞机的翅膀，统一在全面从严治权中，充分表达了党建思想的系统性。
