医疗体制改革的目标是实现资源的合理配置，确保包括弱势群体在内的所有人都能享受政府医疗服务。
"看病难，看病贵是群众反映最强烈的民生问题。医疗体制改革就是为了解决这些问题。在新形势下，看病难和看病贵变得日益突出，如下：
1、卫生资源配置不合理。70%左右的卫生资源集中在城市，其中很多优质资源集中在大中型医院。城乡公共卫生和基层医疗机构资源严重不足。新医改前夕，约11%的行政村没有村卫生室。此外，服务能力和质量低下，城乡差距不断扩大，人民无法轻松享受基本医疗卫生服务。
2、医疗保障体系不完善。基本医疗保障体系不强，受益水平相对较低，这可以不能有效地解决因病致贫和因病返贫。
3、公立医疗卫生服务机构公益性减弱。医疗机构主要依靠以药补医，而且存在一个只注重经济效益而忽视社会效益的逐利问题。过度的医疗检查、更多的隐性费用、失控的管理和扭曲的服务行为增加了患者的负担。
4、药品生产流通秩序不规范，价格虚高。医疗行业集中度低，流通环节过多，运营成本高，而低价药品生产难以为继。医疗服务机构存在收取佣金、虚高药价、不合理用药等严重损害群众利益的行为。
5、分析看病难、看病贵从现有医疗资源分布明显不均衡的角度来看。在大城市，看病难，看病贵可以从两个方面来看。看病难，难获得高端专家、高水平医学疑难杂症诊疗；它看医生很贵。首先，它医生给感冒发烧的病人开几百美元的处方是很贵的。治疗常见病的医疗机构很多，但大多数患者都涌向大医院看专科门诊。
1、深化医疗体制改革，有利于建立更加合理的相关医疗机制。客观来说，我国很多地区的医疗卫生保障制度不是很统一，甚至不是很合理，报销制度和比例都不一样。甚至很多老百姓在享受医保的具体医疗待遇上也有困难。深入实施医药分开的医疗体制改革，就是要进一步完善和统一相关医院的医疗制度，建立统一规范的医疗体系，让老百姓获得更多的满意度和归属感。
2、深化医疗体制改革，有助于医院提高治疗效率。以前医院和相关药商之间存在利益关系。医院的医生在开药的时候，或多或少考虑了相关药品的销售，尤其是那些价格昂贵的药品，不仅不能帮助医院医生及时治疗病人，还在一定程度上增加了老百姓的医疗成本。取消药品加成在一定程度上减少了老百姓的购药支出。
3、深化医疗体制改革有利于促进基层卫生事业发展。通知进一步推进了医疗体制改革，进一步加强了医疗卫生行业的管理和规范，提高了整体医疗水平。
