矩阵运算是指矩阵A，m行n列的矩阵(共m*n个元素)，其他数或其他矩阵。求矩阵的逆矩阵，矩阵的特征值和特征向量。矩阵乘法，增广矩阵。

关于矩阵，可以参考参考书《矩阵论》，华中科技大学出版社，杨明写的书《矩阵论》特别好。

三维变换是指通过一定的变换和转换，将一个三维向量，如向量A=(1，2，3)，变换成一个新的三维向量B。三维向量可以看作1*3矩阵，即一行三列的矩阵，所以三维变换是矩阵运算的特例。这个特殊的矩阵运算的输入是1*3矩阵，输出也是1*3矩阵。

准确的说，没有人会把一个向量叫做矩阵，因为向量是一个特殊的矩阵，它可以概括出一个更细更准确的分类向量。大部分只是叫向量，不叫矩阵。

所以三维变换的本质是矩阵运算，但并不是这么叫的；但是矩阵运算不是三维变换。